E-BOOK นวัตกรรมการเรียนการสอน
แบบจำลองโครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีนชนิดเกลียวอัลฟา

แบบจำลองโครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีนชนิดเกลียวอัลฟา


(Model of a Secondary Structure of Protein: 
The Right-Handed Alpha Helix)

 

แบบจำลองโครงสร้างโปรตีนแบบ เกลียวอัลฟา แสดงการม้วนตัวของสายโพลีเปปไทด์เป็น เกลียวแบบเวียนขวา ซึ่งเมื่อมองที่ปลายเกลียวจากส่วนที่ใกล้ตัวไปสู่ส่วนที่ไกลออกไป จะเห็นทิศทางการม้วนของเกลียวเป็นไปใน ทิศตามเข็มนาฬิกา ไม่ว่าจะมองจากปลายเกลียวด้านใด หนึ่งรอบเกลียวอัลฟามีกรดอะมิโน 3.6 ตัว และมีระยะระหว่างรอบเท่ากับ 5.4 อังสตรอม แขนงข้าง (side chain: R) ของกรดอะมิโน (สีเขียว)ซึ่งต่ออยู่กับอัลฟาคาร์บอนจะชี้ออกสู่ทางด้านนอกของเกลียว หากมองตามแกนของเกลียวจะเห็นว่าแขนงข้างแต่ละตัว ทำมุมกับแขนงข้างตัวถัดไป 100 องศา

 

โครงสร้างโปรตีนแบบเกลียวอัลฟาอยู่ตัวได้ดีเนื่องจากมีพันธะไฮโดรเจนระหว่างกลุ่ม CO ในพันธะเปปไทด์ของกรดอะมิโนตัวหนึ่งกับกลุ่ม NH ในพันธะเปปไทด์ของกรดอะมิโนที่อยู่ถัดไปอีก 4 ตัว จำนวนอะตอมคาร์บอน (สีดำ) และไนโตรเจน (สีน้ำเงิน) ในหนึ่งรอบเกลียว รวมกับสองอะตอมของไฮโดรเจน (สีขาว)และออกซิเจน (สีแดง) ที่ทำพันธะไฮโดรเจน 1 พันธะ มีจำนวน 13 อะตอม


ในโปรตีนทั่วไปที่ไม่เป็นเส้นใย เกลียวของโปรตีนอาจไม่เป็นเกลียวอัลฟาดังเช่นที่เห็นตามแบบจำลองนี้ แต่อาจจะเป็นเกลียวอัลฟาที่บิดเบี้ยวไปบ้าง หรือเป็นเกลียวเวียนขวาในลักษณะอื่น

 

โพสเมื่อ : 16 พ.ย. 2555,20:48   อ่าน 1996 ครั้ง